Insgesamt nehmen 60 Ganztagsschulen der verschiedenen Schulformen, aus dem gesamten Bundesgebiet am Projekt Freie Lernorte teil.
In einer ersten Ausschreibungsphase haben sich im Frühjahr 2005 Schulen mit ihren Konzepten zu Freien Lernorten um die Projektteilnahme beworben. Unter den 30 ausgewählten Schulen sind Vertreter aller Bundesländer und nahezu aller Schulformen. Diese erste Gruppe von Projektschulen wird über einen Zeitraum von zwei Schuljahren begleitet. Im Rahmen der Begleitung nehmen diese Schulen nicht nur an Erfahrungsaustauschtreffen und Fortbildungen teil, sie geben auch ihre Erfahrungen seit dem Schuljahr 2006/07 an die zweite Gruppe von Projektschulen weiter.
Die Ausschreibungsphase für die Auswahl der zweiten Gruppe von wiederum dreißig Ganztagsschulen wurde im März 2006 abgeschlossen. Die in der zweiten Ausschreibungsphase ausgewählten Ganztagsschulen können bei der Konzeption und Einrichtung Freier Lernorte unmittelbar von den Erfahrungen aus dem ersten Jahr der Begleitung profitieren. Aber auch die Schulen der ersten Projektphase fangen nicht bei Null an: Ausgewählte beratende Projektschulen aus dem In- und Ausland stehen hier mit Rat und Tat zur Seite, nehmen an Veranstaltungen teil, unterstützen bei Fortbildungen und berichten von ihren eigenen Erfahrungen.